Jan Hautekiet studeerde piano en kamermuziek aan de Academie van Sint-Pieters-Woluwe en taal- en letterkunde, filosofie en audiovisuele communicatie aan de Katholieke Universiteit Leuven. Daarnaast volgde hij ook een journalistenopleiding.
Hautekiet startte zijn radiowerk in 1979 bij BRT 1 met het muzikale avondprogramma ‘Wie niet kijken wil, moet luisteren’.
In 1980 werd hij producer van zowel maatschappelijke als muziekprogramma's.
Op 1 april 1983 startte hij mee de radiozender Studio Brussel op. Hij deed er verslaggeving en productie en presenteerde onder meer het interviewprogramma ‘De Tafel’ en het interactieve ‘Hallo Hautekiet’, waarmee hij Humo's Pop Poll won van 1993 tot 2000, in 1996 de Prijs van de Radio- en TV-kritiek kreeg en in datzelfde jaar genomineerd werd voor de Prix Monte-Carlo.
In 1998 werd hij nethoofd van het station. In 2002 maakte Hautekiet in die functie de overstap naar Radio 1.
Eind 2007 werd hij strategisch adviseur bij de VRT.
Van 2007 tot 2010 presenteerde hij de actualiteitsquiz Dubbelcheck op Radio 1.
In 2011 presenteerde hij er het interviewprogramma ‘Touché’.
In september 2012 startte hij bij Radio 1 het dagelijkse interactieve discussieprogramma ‘Hautekiet'.
In de nacht van 8 op 9 juni 2018 presenteerde Hautekiet in een marathonuitzending van 9 uur nog eenmalig Hallo Hautekiet als definitief afscheid van de radio.